在真实性审查的基础上，注册机关还必须审查注册申请的合法性。主要是根据申请人提供的文件、材料，对照《公司法》规定的公司设立、变更和注销必须符合的条件进行审查。就设立注册来说，合法性审查的项目主要是：股东或发起人是否符合《公司法》规定的设立有限责任公司和股份有限乏公司的要求；验资报告显示的注册资本是否符合公司章程的规定并是否符合法定最低注册资本限额；公司名称的选择是否符合《公司注册管理条例》及《公司名称注册管理规定》的要求；法律、规规定必须经过政府部门批准的，是否获得政府部门的批准；公司章程是否符合《公司法》的规定等。就变更注册来说，合法性审查的主要项目是：公司作出的变更公司住所、注册资本、公司名称、营业范围等重大事项的决议或决定是否符合《公司法》规定的形式、参加人员构成、表决的比例、主管部门的芋准等要求；公司是否及时修改了公司章程等。就注销注册来说，合法性审查的主要内容是公司终止的决议、决定是否合法、是否，合符公司章程的规定；公司是否进行合法清算，是否合法地进行公司债务的清偿等。